La Iglesia Cristiana Latinoamericana está administrada por el directorio, compuesto por el consejo de ancianos y el diaconado.
El diaconado se encarga de las diferentes áreas administrativas con apoyo de la secretaría y la tesorería, mientras que el pastor y los ancianos se encargan de las necesidades espirituales de la iglesia. Cada diácono tiene asignado un área de trabajo específica.
Pastor: Abdías Velásquez
El Pastor preside el directorio y es la guía espiritual de la iglesia. El se encarga de predicar, dar consejería, visitar a los enfermos y acompaña a cada ministerio, guiando a cada lider.

Consejo de ancianos
Consejo de ancianos:
El consejo de ancianos compuesto por Carlos Arroyo y Fernando Yañez asisten el trabajo pastoral de la iglesia en las areas de predicación, consejería, discipulado y visitar a los enfermos.
Diaconado
Diaconía de finanzas, evangelismo y misiones:
Marcela Ledesma

Diaconía de alabanza y ayuda social:
Manfred Nickel

Diaconía de servicio y matrimonios:
Esmeralda Espinosa

Diaconía de ujieres:
Claudia Rada

Diaconía de ministerios de hombres:
Juan Ruiz

Administración
Secretaría:
Carlos Arroyo
Encargado de la correspondencia interna y externa de la Iglesia y de la coordinación de muchas actividades dentro y fuera de la Iglesia.
Tesorería:
Marcela Ledesma
Encargadas de las finanzas de la Iglesia.